冬季是黄皮果树进入休眠期的重要时期，此时，果园的清园工作显得尤为重要。果农们需要剪除病枝、病叶，清除修剪后的枯枝落叶，集中烧毁，以减少翌年病虫源。此外，还可以采用深翻改土的方法，消灭在土壤中越冬的病虫。同时，用0.3波美度石硫合剂喷洒果树，可以有效消灭在树上越冬的病虫。
在药剂防治方面，如果发现病害，可以使用70%甲基硫菌灵可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液进行防治。对于蚜虫、木虱、粉虱等害虫，可以使用50%抗蚜威可湿性粉剂1500～2000倍液，或10%吡虫啉可湿性粉剂1000～1500倍液进行防治。这些措施都是冬季黄皮果园管理的重要环节，但并不意味着一定要频繁喷洒农药。
冬季，黄皮果树进入了花芽分化期，如果冬梢长势太强，会严重影响花芽和花果的发育。因此，控制冬梢生长是非常必要的。这时，果农们可以选择在12月至翌年1月间，对黄皮果树喷施多效唑等消长激素的冬梢控制剂，以促进花芽分化，缩短花穗长度。
需要注意的是，使用冬梢控制剂时，一定要严格按照说明进行，避免过量使用导致花芽消亡。同时，还要对药剂进行充分搅拌和混合，确保药效达到最佳。另外，如果完全失去生长能力的枝条，应该及时剪除，以免影响黄皮树的正常生长发育。
黄皮果树喜温暖湿润的环境，对低温的适应能力较弱。因此，在冬季，果农们还需要采取一系列的保温防寒措施。比如，对于幼年树，可以采用整株搭草棚架防寒；对于大树，则可以用废旧编织塑料袋做成网罩，或用稻草帘等防寒物覆盖。此外，还可以通过枝干涂白、树干包扎、根颈培土等方法，提高果树的防寒能力。
在果园中均匀堆放杂草、干枯枝叶或其它发烟物进行熏烟，也是提高果园气温、防止或减轻冻害的有效方法。但需要注意的是，熏烟时间不宜过长，一般以6-8小时为宜。
冬季，黄皮果园的土壤管理同样不能忽视。果农们需要及时挖沟排水，降低地下水位，同时进行中耕，以改善土壤透气状况，促进根系生长。此外，根据受冻害程度，果农们还需要采取相应的修剪技术。成年树在气温回暖后，可以采取“小伤摘叶、中伤剪枝、大伤锯干”的原则进行修剪；幼年树则需要在天气回暖后剪去枯枝。
