水产养殖硫酸铜用后1-2天即可解毒。硫酸铜可用来防治各类鱼病，比如卵鞭虫病、隐鞭虫病、鱼波豆虫病、毛管虫病、车轮虫病等及其甲壳动物造成的鱼病。可用硫酸铜进行鱼种药浴，可以有效的消灭掉鱼表皮和鱼鳃上的病菌、原虫，同时，硫酸铜对于未产生胞囊的粘胞子虫也有一定的效果。
还能用硫酸铜对鱼种的专用工具以及食物进行消毒。硫酸铜也能够控制有害藻类生长，可以消除掉因为青泥苔及絮状藻类植物粘附，所造成的鱼、虾、蟹及螺蚌的病虫害。
水产养殖业需要使用硫酸铜时，其用量的掌控是一个非常值得探讨的问题。在水产养殖业中硫酸铜用量与水体肥度、有机物和悬浮物含量、盐度、pH值成正比，因此在水产养殖用硫酸铜时要具体分析池中的具体情况，投入适当的用量。
因为不同的鱼类对硫酸铜的适应度不一样，所以在对不同鱼类的水产养殖池塘应使用不同用量的硫酸铜，如：鲑鱼苗的养殖池中铜离子的含量不应超过0.012mg/L，因为当超过这个值是鲑鱼苗摄食量明显减少，超过0.017mg/L时会直接停食；白鲢对硫酸铜的50%的回避浓度是0.3ppm。此外当硫酸铜浓度低于0.5ppm时对鱼的寄生虫没有杀灭作用，超过0.8ppm时又易引起鱼的中毒死亡。
因为硫酸铜在使用过程中会其铜离子容易在生物体内蓄积，引起鱼的肾坏死、造血功能下降、降低肠道消化酶的活性，引起消化系统紊乱，所以水产养殖用硫酸铜用量需谨慎，投入前要经过详密的思考与计算。
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