1、需要培训专门的技术人员。人工授精是一项相对操作较复杂的工作，需要有专门的、熟练的技术人员才能达到满意的效果，如果由于某一环节的疏忽，会对猪场的效益造成很大的影响。2、猪人工授精，长期保存稀释精液有一定的难度。现在猪常温保存精液大概在7天左右，现在的冷冻保存技术还需要进一步研究才能在生产中应用。3、增加实验室和试剂成本，必须具备常用的设备如显微镜、消毒设施等。

4、如果使用感染了疾病公猪的精液，疾病传播的速度要比自然交配方式快得多。

5、如果养猪场本身的生产水平不高，技术不达标，使用人工授精可能导致子宫内膜炎增加，受孕率低，母猪产仔数小。建议先学技术，后进行小规模人工授精试验，或自然交配与人工授精结合，随着生产水平和技术的不断提高，再进行推广。