睡莲冬天放水里也可以拿出来，冬季可将睡莲从土壤中取出，清洗掉淤泥后，倒入没过根系的水分。修剪完成睡莲根，也可放入容器内，放入冰箱中储存，温度控制在5℃左右。还可将睡莲根从盆土中取出，用纱布包裹放置到通风环境下储存，也可直接放入真空袋子密封保存。

睡莲根还可进行冷冻保存，可将修剪完成的睡莲根，放置到通风透气的容器内，放入冰箱中进行冷藏，温度控制在5℃左右，周围溼度控制在60%以上。进行冷冻的睡莲能保存100天左右，等春季气温回暖后便可取出，重新栽种入土。

睡莲冬天放水里也可以拿出来，睡莲本身具有较强的耐寒性，可直接放在水中。可在冬季来临前，将睡莲从土壤中挖出，清洗掉根部所残留的淤泥，放入淡水中浸泡，水位刚好没过根部，并在上方覆盖一层塑料薄膜，一般能保存2个月左右不腐烂。

也可挖取出生长粗壮的睡莲根，放入盒子中进行密封保存，用真空机吸出全部的空气，睡莲的根部便会悬浮在空中，保鲜时间较长。可等到需要播种时，剪开真空袋取出，进行适当修剪消毒后，直接入土栽种。

将睡莲从盆土中取出后，也可不清洗掉淤泥，使用干净的纱布进行包裹，放置到通风透气的环境下保存，保证根系始终处于干燥的状态。可适当修剪掉长出的嫩芽。保存时间较长，能一直保存到开春。